Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HECTD4Q9Y4D8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms