Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HDGFL3Q9Y3E1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms