Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM2AQ9Y2K7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms