Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RCE1Q9Y256 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RCE1Q9Y256 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms