Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVW-1Q9UQF0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms