Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SETD1BQ9UPS6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SETD1BQ9UPS6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms