Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED23Q9ULK4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms