Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RARRES3Q9UL19 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RARRES3Q9UL19 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RARRES3Q9UL19 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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RARRES3Q9UL19 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RARRES3Q9UL19 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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