Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRTO4Q9UKD2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRTO4Q9UKD2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms