Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms