Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPC1L1Q9UHC9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms