Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA9Q9UGM1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms