Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTSFQ9UBX1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTSFQ9UBX1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms