Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLKQ9UBT6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms