Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USP36Q9P275 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP36Q9P275 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms