Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCN3Q9P1Z3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms