Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MIS18AQ9NYP9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms