Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDL2Q9NX52 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms