Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCM2LQ9NUG4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms