Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEPEQ9NQ76 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms