Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO1B3Q9NPD5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms