Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACKR4Q9NPB9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms