Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM60AQ9NP50 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms