Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYP4F12Q9HCS2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CYP4F12Q9HCS2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms