Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP29Q9HBJ7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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