Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms