Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHACTR1Q9C0D0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms