Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF17Q9BXT8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms