Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BBS2Q9BXC9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms