Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2Q9BX26 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms