Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms