Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIOK2Q9BVS4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms