Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCMBPQ9BTE3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms