Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD6Q9BRQ6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms