Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms