Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms