Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ALPK1Q96QP1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms