Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL15Q96M94 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms