Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms