Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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