Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ1Q96JM4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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