Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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GTF3C6Q969F1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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