Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOPBP1Q92547 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPBP1Q92547 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms