Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC4Q8WW27 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms