Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC12Q8WUD4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC12Q8WUD4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms