Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AGR3Q8TD06 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms