Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms