Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CSNK2A3Q8NEV1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSNK2A3Q8NEV1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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