Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms