Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX29P2Q8IUI4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms